O xdg-open
comando abre um arquivo especificado com o aplicativo padrão associado ao tipo. Existe uma alternativa que acionaria a caixa de diálogo de escolha do aplicativo nativo do sistema (que aparece quando você clica com o botão direito do mouse em um arquivo e seleciona "Abrir com...")?
xdg-open foi projetado para abrir arquivos e páginas da web no aplicativo padrão do usuário. Não vejo opção de fazer o contrário.
A página de manual mostra:
Alternativo:
xdotool
Claro, você terá que alterar o alias para corresponder às suas configurações para abrir essa caixa de diálogo.
Também:
Se não estiver instalado, instale-o, se puder ser instalado.