Substitua o ``` de abertura de pares ``` duplos por ```bash

Para substituir todas as outras ```linhas por ```bash, provavelmente é mais fácil com awk:

awk '$0 == "```" && alt = 1 - alt {$0 = "```bash"}; {print}' < file

Para substituir todas as ``` linhas, isso seria:

sed 's/^```$/&bash/'

Não há necessidade de capturar explicitamente a correspondência (que, por sinal, é feito com \(...\); (...)só funcionaria depois de habilitar expressões regulares estendidas, conforme suportado por algumas sedimplementações com -Eou -r) quando é a correspondência inteira, pois a correspondência inteira é capturada de &qualquer maneira.

Não há necessidade de uma gbandeira. O gsinalizador é para substituir todas as ocorrências na linha , mas aqui pode haver apenas uma ocorrência por linha, pois estamos ancorando o padrão no início e no final da linha com ^e $.

Com sed, para substituir todas as outras linhas, você poderia fazer:

sed '
  /^```$/ {
    s//&bash/;:1
    n;//!b1
  }'

Em uma linha:

sed -e '/^```$/ {s//&bash/;:1' -e 'n;//!b1' -e '}'

Com a implementação GNU de sed, você pode encurtá-lo para:

sed '/^```$/{s//&bash/;:1;n;//!b1}'

(mas essa não é uma sedsintaxe padrão como POSIXly, você não pode ter nenhum código após os comandos :ou be precisa haver um ;ou nova linha antes }de ).

EDITADO

O comando sed 's/^(```)/(```bash)/g'não funciona porque os colchetes são interpretados literalmente.
Você provavelmente tem que escapar dos colchetes como em

$ sed 's/^\(```\)/```bash/g'

Como alternativa, você pode habilitar expressões regulares estendidas:

$ sed -E  's/^(```)/```bash/g'

para que os colchetes não precisem ser escapados.

Ou, apenas remova os colchetes:

$ echo '```' | sed 's/^```/```bash/g'
```bash

Para corresponder apenas à abertura ```, você pode usar um regexp como este:

$ sed --null-data -E 's/[`]{3,3}([^`]*)([`]{3,3}){0,1}/```bash\1\2/g'

Advertência : Falha se um ` (backtick) for encontrado entre sequências de backticks triplos.

Ele usa --null-datapara deixar sedtratar a entrada como uma única linha (na verdade, linhas separadas por caracteres nulos) e então procura por sequências de ```-text-``` para substituí-las por ```bash-text-```.

eu tentaria algo como

 perl -ple 'if (m/^```$/) { if (--$|) { s/$/bash/ } }' data.md

Você pode tentar usar aspas simples para o sedcomando:

sed 's/^(```)/(```bash)/g'

Isso é usado para evitar a interpretação dos símbolos do bash

Mas com base no seu arquivo é melhor você usar algo como:

sed 's/^```/```bash/g'