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user3523406
Asked: 2018-06-26 15:02:40 +0800 CST

ncbi-blast: não encontrado

  • 772

Eu consegui ncbi-blast: not foundapesar de que deveria estar lá ( https://packages.debian.org/jessie/amd64/ncbi-blast+/download )

FROM debian:jessie
# based on https://github.com/docker-library/php/blob/master/5.6/jessie/apache/Dockerfile

RUN apt-get update  && apt-get install -y --no-install-recommends \
        libapache2-mod-perl2 \
        libcgi-pm-perl \
        php5-cgi \
        php5-mysql \
        libapache2-mod-php5 \
        php5-mysql \
        php5-gd && \
        ncbi-blast+ && \
        rm -rf /var/lib/apt/lists/*

O que eu perdi?

debian software-installation

1 respostas

  1. Best Answer

    Como Mark Plotnick comentou , parece que você reorganizou as linhas em algum ponto, adicionando a linha para ncbi-blast+depois pgp5-gd, mas esqueceu de remover o &&no final de php5-gdpara que a próxima linha de continuação liste outro pacote em vez de terminar o comando anterior. O comando que você tinha teria solicitado a instalação dos pacotes até php5-gd, após o que teria tentado executar ncbi-blast+ , que presumivelmente ainda não estava instalado e, portanto, teria gerado um erro, após o qual não teria executado o rmcomando . Use o seguinte, em vez disso:

    RUN apt-get update  && apt-get install -y --no-install-recommends \
        libapache2-mod-perl2 \
        libcgi-pm-perl \
        php5-cgi \
        php5-mysql \
        libapache2-mod-php5 \
        php5-mysql \
        php5-gd \
        ncbi-blast+ && \
        rm -rf /var/lib/apt/lists/*
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