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A. B
Asked: 2018-04-16 10:39:07 +0800 CST

Como passar valores de variáveis ​​para um script e executá-lo em uma linha?

  • 772

Tenho um arquivo (temp_4n.in) com as seguintes linhas:

 5  C   172.0696  
 5  C   135.6942  
 5  H   30.9062  
 5  H   31.8124  
 12 H   31.0377  
 12 O   293.0612  
 12 H   32.4678

Tenho um script (testsc.txt) que vai extrair o último H das linhas que começam com um determinado número que irei alterar regularmente:

 grep $'^${mold}\tH' temp_4n.in | tail -1 > temp_5n.in

Porém, quando executo o script (querendo, por exemplo, a linha começando com 12) utilizando o seguinte comando, ele falha:

 qsub -v mold=12 ./testsc.txt

Acho que isso tem algo a ver com o primeiro '$' no comando grep sendo considerado um parâmetro e sendo substituído erroneamente. Alguém pode me ajudar a descobrir qual é o problema?

parameter

1 respostas

  1. Best Answer

    qsub -v varname=valuedefine varnamepara o valuefornecido no ambiente do trabalho enviado.

    No script que você envia, você usa esse valor em um grepcomando, mas a string que contém a variável é colocada entre aspas simples, impedindo que o shell a expanda.

    Em vez disso, seu script deve estar usando

    grep "^$mold[[:blank:]]H" temp_4n.in | tail -1 > temp_5n.in

    A inicial $do seu código ( $'...') não é necessária aqui e, em vez disso, usamos [[:blank:]]para corresponder a um espaço ou tabulação.

    Uma alternativa seria usar awkno seu script:

    awk -v mold="$mold" '$1 == mold && $2 == "H" { this = $0 } END { print this }' temp_4n.in >temp_5n.in

    Isso usa comparações de strings (não expressões regulares) para testar a primeira e a segunda coluna e, quando uma linha correspondente é encontrada, a linha inteira é salva na variável this. No final, o último valor de thisé impresso. Isso substitui ambos de grepe tail.

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