Início / unix / Perguntas / 417426
Accepted
Osman Mamun
Asked: 2018-01-16 22:18:14 +0800 CST

Melhor maneira de cancelar todos os trabalhos SLURM da saída do comando shell

  • 772

Enviei muitos scripts de trabalho SLURM com limite de tempo de depuração (esqueci de alterar o tempo para a execução real). Agora todos eles são enviados ao mesmo tempo, então todos começam com o ID de tarefa 197xxxxx. Agora, eu posso fazer 

squeue -u $USER | grep 197 | awk '{print $1}'

para imprimir os IDs de trabalho que desejo excluir. Mas como eu uso o comando scancel em todos esses IDs. A saída do comando shell acima seria semelhante

19726664
19726663
19726662
19726661
19726660
19726659
19726658
19726657
19726656
19726655
19726654
19726653
19726652
19726651
19726650
shell slurm

5 respostas

  1. Best Answer
    squeue -u $USER | grep 197 | awk '{print $1}' | xargs -n 1 scancel

    Verifique a documentação para xargsobter detalhes. Se scancelaceitar vários IDs de trabalho (deveria), você pode omitir a -n 1parte.

    • 29

  2. Para cancelar todos os meus trabalhos slurm (omitindo os OP's grep 197), descobri que precisava podar a primeira linha da saída do squeue, que continha os títulos das colunas, também:

    squeue -u $USER | awk '{print $1}' | tail -n+2 | xargs scancel
    • 14

  3. Uma versão um pouco mais curta com apenas os números de trabalho impressos por squeue:

    squeue --me -h -o "%i" | xargs scancel
    • 5

  4. Como esta é uma solução simplificada, você também pode fazer isso:

    squeue -u $USER -h | awk '{print $1}' | xargs scancel

    Isso omite as opções de formatação e, em vez disso, remove o cabeçalho com o -hsinalizador.

    • 1

  5. Isso é o que eu geralmente uso:

    1. cancelar todos os meus trabalhos:

      scancel -u <my_user_name>

    2. cancelar por filtragem: ou seja, cancelar todos os trabalhos com um jobId que comece por 26699):

      squeue --format="%.18i" --me -h | grep -w 26699.* | xargs scancel
    • 0

relate perguntas