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Jithu
Asked: 2017-12-27 03:48:02 +0800 CST

Alternar entre openmpi e mpich como padrão usando o terminal linux

  • 772

Eu preciso executar um código usando mpicc (parallel gcc). Um servidor tem dois pacotes de mpicc instalados, a saber , OPENMPIe MPICHem /usr/local/OPENMPIe , /usr/local/MPICHrespectivamente. Por padrão mpicc de OPENMPI está sendo usado

which mpicc

shows/usr/local/OPENMPI/bin/mpicc

Meu código é construído para MPICH. Em vez de chamar mpicc de MPICH usando o caminho completo todas as vezes. Existe uma maneira fácil de fazer /usr/local/MPICH/bin/mpicccomo padrão até que eu conclua meu trabalho e depois mude de volta para/usr/local/OPENMPI/bin/mpicc

bash path

1 respostas

  1. Best Answer

    Eu acho que um aliasfuncionaria perfeitamente para sua situação. Você pode adicionar o seguinte ao seu .profileou .bash_profile:

    alias mympicc='/usr/local/MPICH/bin/mpicc'

    Uma solução mais permanente (mas ainda reversível) é adicionar o MPICHlocal ao seu caminho ANTES do OPENMPIlocal. Facilmente feito adicionando o seguinte seu .profileou .bash_profile:

    export PATH="/usr/local/MPICH/bin:$PATH"

    Quando você digita um comando como mpicc, se não estiver em seu diretório atual, seu shell irá procurá- PATHlo, em ordem, por isso é importante qual posição você o coloca para definir a precedência.

    Se você quiser ter algum tipo de chave que possa usar para "alternar" facilmente entre os dois, você pode criar algum tipo de função e adicioná-la ao seu .bashrc(ou .profile/ .bash_profile ? ):

    use_mpicc () {
    shopt -s nocasematch
    case "$1" in
        mpich) export PATH="...:/usr/local/MPICH/bin:/usr/local/OPENMPI/bin:..." ;;
        openmpi) export PATH="...:/usr/local/OPENMPI/bin:/usr/local/MPICH/bin:..." ;;
        *) return 1 ;;
    esac
    shopt -u nocasematch
}

    Neste exemplo, usei reticências no lugar do caminho real. Na verdade, eu recomendo especificar o caminho completo nesta função (se usado) em vez de usar o PATH="Stuff_I_Need_added:$PATH"método: , pois ele continuará sendo adicionado ao seu PATHtoda vez que você chamar a função, podendo fazer com que ela se torne excessivamente longa.

    Você chamaria isso como:

    $ use_mpicc mpich
$ # OR
$ use_mpicc openmpi

    Mais leitura sobre como definir seu caminho

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