Início / unix / Perguntas / 410710
Accepted
user3138373
Asked: 2017-12-14 10:02:09 +0800 CST

dividindo uma linha em array no bash com tabulação como delimitador

  • 772

Eu tenho um arquivo no seguinte formato e é separado por tabulações

a   k   testis  adult   male    8 week  rRNA
b   k   testis  adult   male    8 week  rRNA
c   k   testis  adult   male    8 week  rRNA

Eu quero fazer alguma operação em cada linha, então estou usando um loop while. Quero dividir cada linha na guia e armazenar, digamos, a 6ª coluna que está 8 weekem uma variável. Estou usando este código, mas não consigo obter o que quero

while read -r line; do tmp=(${line///}); col6=${tmp[5]}; echo "$col6"; done < file.txt

Isso me dá 8e não 8 week. 8 semanas tem um espaço entre 8 e semana e, portanto, quero dividir a linha na guia.

bash array

1 respostas

  1. Best Answer

    A atribuição de matriz tmp=(${line///})divide o valor em qualquer caractere que IFScontenha, o que por padrão inclui tabulações, espaços e novas linhas. (Não vejo o que a substituição vazia faz.) Para dividir apenas nas guias, defina IFSassim:

    foo=$'a\tk\testis\tadult\tmale\t8 week\tRNA'
IFS=$'\t'
tmp=($foo)
echo "${tmp[5]}"

    Embora isso ainda deixe o globbing como um problema e, como você já está usando while read, você pode usar read -a tmp(somente no Bash, substitua -apor -Aksh/zsh/yash), ele divide a linha de entrada com base em IFSe armazena os campos resultantes como elementos de a matriz nomeada:

    $ while IFS=$'\t' read -r -a tmp ; do
    echo "${tmp[5]}"
done <<< $'a\tk\testis\tadult\tmale\t8 week\tRNA'

    Isso imprime 8 week. A outra vantagem disso é que a alteração IFSsó tem efeito durante o read, não para o restante do script.

    Cuidado, no entanto, que readremove os campos vazios ao usar a tabulação como delimitador. Em zsh, você pode substituir IFS=$'\t'por IFS=$'\t\t'para impedir que isso aconteça.

    Claro, se soubermos o número/significado dos campos, poderíamos apenas readdividi-los para separar as variáveis ​​nomeadas:

    ... IFS=$'\t' read -r col1 col2 col3 ...

    Ou, se você quiser imprimir apenas uma coluna, use cut:

    cut -d$'\t' -f 6  < file.txt

    Se você tiver colunas vazias cut -d$'\t'e IFS=$'\t'tiver um comportamento diferente em relação a elas. Cut tratará cada tabulação individual como um separador distinto, enquanto readusará tabulações consecutivas como apenas um único separador. Ou seja, a string foo<tab><tab>barserá lida como apenas duas colunas por read, mas três colunas por cut.

    Você não pode alterar isso para tabulações, mas os caracteres de impressão são sempre reconhecidos como separadores distintos, portanto, você pode alterar as tabulações para algum caractere que não apareça nos dados e usá-lo como separador, por exemplo ... | tr '\t' : | IFS=: read -r -a tmp.

    • 16

relate perguntas