Existe uma maneira de truncar a tabela que possui uma chave estrangeira?

Não, você precisa excluir e recriar as chaves ou aguardar a exclusão e a propagação novamente. Desativar a chave estrangeira temporariamente pode tornar a exclusão mais rápida, mas ainda não permitirá um truncamento.

ALTER TABLE [dbo].[tablename] NOCHECK CONSTRAINT ALL;

-- delete, reseed, etc.

ALTER TABLE [dbo].[tablename] WITH CHECK CHECK CONSTRAINT ALL;

É muito fácil automatizar isso criando um SQL dinâmico a partir das tabelas de metadados, dependendo exatamente de quais tabelas você precisa segmentar. O acima é apenas uma amostra para demonstrar como isso é feito para uma única tabela. Por exemplo, isso fará isso para cada tabela que for alvo de uma chave estrangeira e tiver uma IDENTITYcoluna:

DECLARE @sql NVARCHAR(MAX);

SET @sql = N'SET NOCOUNT ON;';

;WITH s(t) AS
 (
   SELECT 
     QUOTENAME(OBJECT_SCHEMA_NAME(referenced_object_id)) 
     + '.' + QUOTENAME(OBJECT_NAME(referenced_object_id))
  FROM sys.foreign_keys AS k
  WHERE EXISTS 
  (
    SELECT 1 FROM sys.identity_columns 
    WHERE [object_id] = k.referenced_object_id
  )
  GROUP BY referenced_object_id
)
SELECT @sql = @sql + N'
  ALTER TABLE ' + t + ' NOCHECK CONSTRAINT ALL;
  DELETE ' + t + ';
  DBCC CHECKIDENT(''' + t + ''', RESEED, 0) WITH NO_INFOMSGS;
  ALTER TABLE ' + t + 'WITH CHECK CHECK CONSTRAINT ALL;'
FROM s;

PRINT @sql;
-- EXEC sp_executesql @sql;

Pode ser que a saída fique truncada, mas isso é apenas uma limitação de PRINT(8K) - o comando real está completo.

PS isso pressupõe o SQL Server 2005 ou superior. Sempre útil especificar sua versão como parte de sua pergunta (geralmente com uma tag).