Se você desabilitar um índice não clusterizado, as estatísticas ainda serão usadas?

Sim, o otimizador ainda usa as estatísticas mesmo quando o índice está desabilitado.

Para a demonstração, estou usando o AdventureWorks2019 OLTP e um exemplo de consulta da documentação

Vou executar esta consulta com plano de execução real

SELECT P.Weight AS Weight, S.Name AS BikeName
FROM Production.Product AS P
    JOIN Production.ProductSubcategory AS S
    ON P.ProductSubcategoryID = S.ProductSubcategoryID
WHERE P.ProductSubcategoryID IN (1,2,3) AND P.Weight > 25
ORDER BY P.Weight;

Se eu abrir o XML do plano de execução, posso ver as estatísticas que estão sendo usadas (excluí alguns atributos para brevidade).

<OptimizerStatsUsage>
  <StatisticsInfo Table="[Product]" Statistics="[AK_Product_rowguid]" />
  <StatisticsInfo Table="[Product]" Statistics="[AK_Product_ProductNumber]" />
  <StatisticsInfo Table="[Product]" Statistics="[AK_Product_Name]" />
  <StatisticsInfo Table="[Product]" Statistics="[_WA_Sys_00000013_1CBC4616]" />
  <StatisticsInfo Table="[Product]" Statistics="[_WA_Sys_0000000E_1CBC4616]" />
  <StatisticsInfo Table="[ProductSubcategory]" Statistics="[PK_ProductSubcategory_ProductSubcategoryID]" />
</OptimizerStatsUsage>

Criarei as estatísticas recomendadas de acordo com o exemplo e reexecutarei a consulta

CREATE STATISTICS BikeWeights
    ON Production.Product (Weight)
WHERE ProductSubcategoryID IN (1,2,3);

No topo, podemos ver o nome da estatística no showplan XML.

Vou descartar a estatística e criar um índice filtrado e não agrupado com a mesma definição (que também criou as estatísticas)

DROP STATISTICS Production.Product.BikeWeights

CREATE INDEX IX_Product_BikeWeights ON Production.Product
(Weight) WHERE ProductSubcategoryID IN (1, 2, 3)

Podemos verificar o índice e as estatísticas com esta consulta DMO:

SELECT 
    i.name
    , i.index_id
    , i.is_disabled
    , s.stats_id
    , s.has_filter
    , s.user_created
    , s.auto_created
FROM sys.indexes AS i
JOIN sys.stats AS s
    ON s.object_id = i.object_id
    AND s.stats_id = i.index_id
WHERE 
    i.object_id = OBJECT_ID('Production.Product')
    AND i.name = 'IX_Product_BikeWeights'

Observe que o sys.statsDMV não possui uma coluna is_disabled

Executar novamente a consulta nos mostra que a estatística nomeada mudou de BikeWeights para IX_Product_BikeWeights .

Agora , desativarei o índice e executarei novamente o DMO e as consultas de teste.

ALTER INDEX IX_Product_BikeWeights ON Production.Product DISABLE

As estatísticas ainda estão sendo usadas mesmo quando o índice está desabilitado .

Para a execução final, vamos descartar o índice (que também descarta as estatísticas)

DROP INDEX IX_Product_BikeWeights ON Production.Product

As estatísticas também estão faltando.