O banco de dados recém-criado do Oracle é preenchido com tabelas de dados

Só para fazer uma analogia. Ao instalar o sistema operacional Windows ou Linux, você esperava zero arquivos em seu sistema de arquivos? O mesmo se aplica ao Banco de Dados Oracle. Após a criação de um Banco de Dados Oracle, haverá toneladas de objetos (tabelas, funções, procedimentos, índices, pacotes, etc.) constituindo seu Banco de Dados Oracle. Todos esses objetos são de propriedade de SYS,SYSTEM,.. (há muitos mais).

Esses proprietários e objetos entram em ação quando você utiliza diferentes recursos do banco de dados. Lembre-se de que o Oracle Database foi desenvolvido há mais de 40 anos e há uma grande quantidade de recursos!

Agora que você deseja criar um banco de dados vazio. Vamos aplicar a analogia do SO novamente. Você teria criado um novo usuário... /home/myuser. Isso é exatamente o que você faz em um banco de dados Oracle também.

Um banco de dados Oracle pode lidar com milhares de usuários e esquemas. (esquema = dono dos objetos, usuário = manipular objetos já criados (DML - selecionar,inserir,atualizar,excluir)).

-- *nix (example: export TWO_TASK=localhost:1521/SERVICE_NAME)
export TWO_TASK=MY_DB_SERVICE
-- Windows
set LOCAL=MY_DB_SERVICE

sqlplus system/password

-- this user is the schema. The owner of your objects.
create user myschema identified by &password
default tablespace USERS
temporary tablespace TEMP
quota unlimited on USERS;     

-- grant privs to the schema
grant create session, resource to myschema;

-- yes, we need to take security into account.
create role myschema_ro;
create role myschema_rw;

-- lets login as myschema
sqlplus myschema/password

-- your database or schema is empty, now create all objects...
create table t (x int);

-- grant access to object
grant select on t to myschema_rw; 

-- we are done with the creation of the schema  

sqlplus system/password

-- no one is going to login as schema owner. 
-- you only unlock this account when you do schema changes
alter user myschema account lock;

-- time to create your app-user-account who is going to access 
-- the database/schema
create user myapp identified by &password;

-- grant privileges for your app-user
grant create session, myschema_rw to myapp;

-- login
sqlplus myapp/password

-- you will see your schema objects are listed
select object_name from all_objects;

-- now, if you want to avoid schema-prefixing (select * from myschema.t) there are some options
-- the first thing you do in your app
alter session set current_schema = MYSCHEMA;

-- now you can do: t is owned by myschema
select * from t;

-- you can create a trigger (log in as myschema)
create or replace trigger after_logon_trg
after logon on myschema.schema
begin
  execute immediate 'alter session set current_schema = MYSCHEMA';
end;
/

Agora você está pronto para criar um banco de dados vazio ( = esquema em termos Oracle) em seu servidor de banco de dados Oracle (instância) onde seus objetos estão protegidos.

Apenas para esclarecer: Um banco de dados é um conjunto de arquivos em disco com um ou vários esquemas (além de sys/system), uma instância é um sistema em execução que é composto pelos arquivos em disco mais as estruturas na memória que definem um pedaço de software.

Boa sorte!

por que existem tantas tabelas já no banco de dados? Como criar banco de dados vazio no Oracle?

Isso é um banco de dados Oracle "vazio" !!

Os bancos de dados Oracle são grandes e complicados Beasts que têm muitos (e muitos) funcionamentos internos com os quais você [quase] nunca precisa se preocupar. Como DBA, você precisa estar ciente deles, mas não muito mais do que isso.

Quaisquer Tabelas, etc., que você colocar nesse banco de dados vão para outros Schemas em outros Tablespaces e nos quais você concede os privilégios apropriados . Em seguida, você cria contas para usar essas tabelas e essas contas verão apenas essas tabelas.