Eu sei que o SQL SERVER 2016 pode coexistir com versões anteriores no mesmo servidor. Eu me pergunto, no entanto, se há alguma pegadinha que eu deveria estar ciente? Temos um servidor de teste que já possui instâncias 2008r2, 2012 e 2014. Existe alguma chance de que haja algo nas instâncias existentes que se comportem de maneira diferente se instalarmos 2016 também no mesmo servidor?
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Cada instância é um serviço separado com seu próprio conjunto de pastas, bancos de dados do sistema, agente e binários para que não afetem diretamente uns aos outros. Todas as instâncias, no entanto, compartilharão as ferramentas de gerenciamento e as versões mais antigas das ferramentas de gerenciamento não podem gerenciar instâncias mais recentes. Você pode evitar problemas instalando as instâncias da versão mais antiga primeiro e instalando a versão mais recente por último. Desta forma SSMS, SSCM, Profiler, etc será a versão 2016 e capaz de gerenciar todas as versões anteriores.
Outra coisa a considerar é a configuração de memória máxima do servidor. Você quer ter certeza de que o total combinado de todas as configurações de memória máxima do servidor menos a memória total na caixa ainda deixará memória suficiente para o sistema operacional e outros aplicativos.
A última coisa que eu consideraria é sua CPU. É possível que as instâncias do SQL consumam recursos de tal forma que outra instância possa efetivamente ficar 'privada'. Uma solução alternativa para isso é definir a máscara de afinidade para que cada instância receba um número definido de CPU.