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user21390049
Asked: 2025-03-07 01:20:55 +0800 CST

traçar uma rede com base em valores fornecidos

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Eu tenho um quadro de dados como este:

df <- data.frame(char1=c('a', 'd', 'i', 'k', 'm', 'd', 'e', 'e', 'q', 'i','q', 'm','n','i'), 
    char2=c('b','a','a','g','n','b', 'o', 'g', 'p', 'b','g','b','k','d'),
 value=c(0.8,0.6,0.6,0.5,0.5,0.4,0.3,0.2,0.1,0.1,0.4,-0.1,-0.2,-0.3))

Quero plotar uma rede na qual cada caractere é um nó e o valor entre cada nó e outro é representado por um link. Quanto maior o valor, mais próximo o link. E os nós que têm valores altos entre si, como o nó 'a', 'b' e 'd' podem ter um gráfico de cluster mostrando suas relações fortes.

1 respostas

  1. Best Answer

    Aqui vai um começo, com base nesta pergunta (eu exponenciei os valores de peso fornecidos porque acho que os pesos têm que ser positivos: você pode modificar isso se quiser)

    library(igraph)
g <- graph_from_data_frame(df)
L <- layout_with_fr(g, weights = exp(df$value))
plot(g, layout = L)

    gráfico de rede mostrando i, a, b, d em um cluster compacto

    Não está claro quais são suas outras opções para pesos negativos; até onde posso ver, não há opções de layout de igraph que permitam pesos negativos ; a maioria desses algoritmos assume que a força atrativa entre nós é proporcional à força de seus pesos (positivos). Pesos negativos poderiam, em princípio, permitir repulsão, mas não acho que isso seja implementado. Falando subjetivamente, não vejo problema em exponenciar; nós conectados por pesos negativos ainda estão mais distantes do que aqueles conectados por pesos positivos (já que a exponenciação mapeia pesos negativos para valores entre 0 e 1).

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